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博客文章
不仅仅是污染物: 流式细胞数据中细胞双联体( Cell Doublets )的两面性
2023-09-06

2023 年 9 月 6 日

作者:Roxanne Collin 博士 

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流式细胞仪和细胞分选技术为研究和临床应用提供了前所未有的血液样本细节,包括人类免疫细胞的表型异质性。然而,La Jolla免疫学研究所 (La Jolla Institute for Immunology) 的 Julie Burel 最近在 CYTO 2023 所作的报告中强调,这些技术获得的单细胞数据中可能存在血源性细胞双联体( Cell Doublets )。 

 

基于面积/宽度/高度的排除法等方法可以去除细胞双联体,但有些复合物仍未被检测到,从而导致数据误读。虽然细胞双联体往往需要去除,但Burel 报告指出,有些双联体是自然形成的,这可以让人们对疾病有更深入的了解。 

在这里,我们将探讨什么是细胞双联体、它们的风险和前景,以及分析人员如何确保结果的准确性。 

 

审视“双联” 

流式细胞仪采集的人体外周血样本中存在双重表达细胞,而Burel的团队最近通过成像技术发现,其中一些细胞实际上是细胞-细胞复合体( cell–cell complexes )。在血液样本的活单细胞圈门中,T 细胞可与其他免疫细胞(如抗原递呈细胞(APC))结合,形成细胞双联。但如果不进行更深入的分析,很容易将细胞双联体作为单细胞进行分析。细胞双联体随后会产生混合细胞系的非典型基因特征,这意味着可能出现以下数据误读: 

  • 特定细胞群百分比虚化 
  • 新的免疫细胞类型识别错误 
  • 功能标记表达归因错误 

 

辨别细胞复合体,以获得更准确的结果 

通过优化的实验和数据分析策略可以区分单体和细胞双联体,从而获得更准确的数据。为了检测潜在双表达细胞中是否存在细胞复合体,Burel 的团队采用了两种不同的方法:通过将细胞分选后进行直接显微成像,确认不同细胞上标志物的表达,从而识别并确认细胞复合体的存在;利用成像流式细胞仪,从检测到的事件图像中生成指标,利用明视野面积和长宽比参数进行计算,以有效排除双联体,确保最终获得准确的数据。 

值得注意的是,Burel 团队发现细胞复合体具有分子特征,这些特征能在蛋白质和 mRNA 水平上将其与单体明确区分开来,为分析人员提供了一种避免数据误读的方法。在用 SSC/FSC 和 SSC/CD45 观察细胞复合体特征时,研究小组发现,与单细胞相比,复合体的 CD45、SSC 和 FSC 表达水平更高。 

但是,细胞复合物并不仅仅是污染物。研究小组发现,T 细胞-APC 复合体在体内形成是一个自然的免疫过程,其数量因疾病状态而异。因此,我们相信它们能为研究和诊断提供更深入的见解。 

 

利用专业知识获得最大的数据可信度 

 

流式细胞术和细胞分选是深入了解血液样本的基本技术,但要确保细胞复合体不会影响结果的完整性,精心筹划和准确分析必不可少。CellCarta的分析团队拥有丰富的专业知识,可根据细胞双连体的情况出现时量身定制策略。CellCarta 利用强大的技术提供广泛的优质服务,让您从研究中获得更深入的见解--请联系我们的团队了解更多信息。 

关于作者
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Roxanne Collin
数据分析部开发组的研究科学家, 免疫学博士学位

Roxanne Collin 是 CellCarta 数据分析部开发组的研究科学家。她拥有免疫学博士学位,主要研究稀有细胞群的免疫遗传学。在 CellCarta,她参与了用于多种免疫细胞类型的流式细胞panel和门控策略的优化工作。