2023 年 1 月 31 日
Anita Ray,技术应用专家
数据分析是实验中最具挑战性和最有价值的部分之一。CellEngine 在细胞特征分析的每一步(从最初的门控到最终的图表细节)中都利用了元数据,从而提高了分析的速度和深度。
可以添加任何类型的元数据
元数据可以直接输入,也可以从电子表格中导入。此外,还有一些工具可用于添加包含在文件名或 FCS 标头中的信息。可以添加任何信息,但常见的信息类别包括:
- 方法学--制备条件、运行日期、细胞计数器或运行样本的研究人员
- 样本--处理条件或浓度、timepoint或其他检测结果
- 来源--细胞系、疾病信息、捐献者 ID 或人口统计学数据
可添加数据验证规则来限制每个变量可接受的值,从而对错别字、误抄数据或不一致(如 "IL-2 "与 "IL2")进行有效的防控。
使用元数据筛选和管理文件
无论文件位于哪里,当在 CellEngine 中选择文件时,都可以根据元数据对它们进行排序和筛选,包括在选取、创建图表、使用内置算法进行降维和聚类或导出统计数据时。这样就可以直接正确选择任何一组文件,而不会出现人为错误。 。
轻松创建图表
元数据可用作坐标轴或数据序列,将数据生成图表。这样就能轻松创建大量图表--例如,按timepoint生成的折线图、按处理方法叠加的一组直方图、使用浓度的剂量反应曲线,或将种群归一化与对照条件进行比较的条形图。可根据任何元数据值进一步过滤包含多个文件的图表,例如,只使用健康供体的样本创建图表。此外,批处理功能还可以循环访问一个或多个元数据变量的选定值,自动生成一系列图表。
如果在实验完成前就开始分析,例如在长达数月的临床试验初期,可以将图表设置为在上传新文件时自动更新。这样,用户就可以在timepoints或样本重复之间开始工作,从而缩短图表定稿的时间。
图 1:为热图添加附加元数据的功能,揭示了流感感染期间,中间型单核细胞增加与病毒脱落之间的相关性。 Data from Rahil Z et al. J Clin Invest 2020;130(11):5800-5816.
利用 CellEngine 提高分析效率
CellEngine 的元数据功能在高度优化的云分析平台中运行。通过这些功能,用户可以不断优化他们的分析,并在问题出现时迅速跟踪您的分析和推测。此外,CellEngine 还有许多其他功能,旨在改进流式细胞仪的分析效率,尤其是大型复杂实验的分析。

Anita Ray 是 CellEngine 的技术应用专家。在加入 CellEngine 团队之前,她曾在转化免疫肿瘤学领域工作,拥有十年的 Cytometry 经验。